有人将巨猿与和它伴生的大熊猫的咀嚼器进行对比，企图寻找它们“灭”与“存”的原因。大熊猫是由食肉类的某种熊演化来的，如今已成为素食者。由于食性大变，它的咀嚼器乃至头形也随之大变，变得与巨猿的很接近。它的牙排列拥挤，无间隙，而且颊齿也变得较宽大，失去食肉类齿系的特征，下颌也较高和宽。
由此推想，大熊猫的食性可能与巨猿较相似，生活于同一环境，食类似的食物，它们互为对方的竞争者。更新世中期开始，中国南部气候逐渐干燥化，大熊猫可能慢慢向主要食竹叶的食性转变，迁移到稍湿润的竹子丛生的地方，直到今日，勉强生存下来。而巨猿对新环境的适应性差，仍然需求大量草本食物，随着气候干燥化的加剧，可供它食用的植物日趋不足，最后导致其灭绝，成为生存竞争的失败者。
关于巨猿的系统位置，现有两种见解。一种见解认为巨猿的牙与人类的很相似，它与人类处于同类系统地位；另一种见解认为，巨猿与人相似的特点只是外形上雷同，本质上还相差很远，所以它是一种类人猿。对巨猿来说，尚未发现作为人类最重要的特征——两足直立行走的证据，所以将它纳入人类范畴的根据是不足的。它的分类位置在何处？又为何突然灭绝……这些疑团尚未解开，有待科学家们进一步的探索和发现。