当时天地初成，天地间有无数劫变，元始天王把太元圣母召到他的玉京山上，后每经一劫，就与她****一次，这样经过了很久很久之后，太元圣母生出了第二个儿子，由于这时她体内还是余气未清，生出来的骨肉是半兽半人：一个有着13个头的儿子，他就是后来东王公，号称元阳父！后来又生了一个女儿九光元女，号称太真西王母，也就是现在的王母娘娘，她亦是半人半兽，有着虎齿，豹尾，易啸，常披发，直到后来得太上老君之助才脱胎换骨，母仪天上！至太元圣母生出第九子玉清真王后，元始天王因为寿数已到，躯体与元神都面临死亡，于是他化作青气，杂在天地精气之中跃入太元圣母身体之中，借法转世重生，太元圣母怀了他十二年后，从胳肢窝里生出了元始天王再世托生的小婴。太元圣母在十二重天中建了一宫，命名为玉清宫，紫云成阁，碧霞为城给他住，做完这一切，太元圣母也因为元气耗尽，没多久就化作了烟尘，与天地重归于一体，而这个小婴后来被称做元始天尊！
东王公住在东海方诸山上的紫府里，治理天地阴阳两气，至玉皇大帝时代时，诸神基本上都是元始天尊等三清的门徒或友人，东王公也成为三界十方四生六道中男子登仙得道者的入门管理员，负责起登录仙籍与成仙后入门理论功课的指导者，被誉为仙上之仙，人间则多称他为东华帝君。西王母则居然在昆仑山上，过起了一阵子无忧无虑的神仙生活。
元始天尊出生的时候，宇宙还是很不稳定，除了厉害如凤凰麒麟这样的神禽异兽，寻常生物无法长期生存下来，后来道教把这个时期称为洪元世纪，到了被道教称为混元世纪的时候，又一位孕育已久的神仙诞生了，他就是灵宝天尊，又称为太上道君。混元世纪结束后的太初世纪才是天地开始热闹起来的时代。