窝沟封闭有严格的适应证，其中年龄因素最关键。根据国内外的临床资料，对于乳磨牙，3～4岁适宜做窝沟封闭；第一恒磨牙6～7岁时适宜做窝沟封闭；第二恒磨牙，11～13岁时适宜做窝沟封闭；一般牙齿萌出后达牙合平面即可做窝沟封闭。
此外，对牙齿形态及患龋倾向（可能性大小）也有选择。适宜做窝沟封闭的牙齿包括：
（1）牙面窝洞窄而深。
（2）有可疑龋的牙齿（可能患有龋齿，但较浅）。
（3）窝沟有初期龋，或牙合面虽有充填物，但仍残留有较深窝沟的牙齿。
（4）对侧同名牙已患龋或有较大患龋倾向的牙齿。
在我国，结合国情，防治儿童龋病任务十分艰巨，窝沟封闭应突出重点，一般应选择3～5岁的乳磨牙和6～8岁的第一恒磨牙，从而以最小的投入获得最大的防龋效果。