上呼吸道感染包括：普通感冒，鼻窦炎，中耳炎，咽炎，扁桃体炎，喉炎，急性会厌炎等。针对不同部位感染，抗生素选择有所不同。
普通感冒以急性鼻咽炎为主，绝大多数为病毒感染，不宜给予抗生素。但如果症状持续7天以上无改善，或反而加重，或伴发热、白细胞增高、C反应蛋白（CRP）增高等，考虑细菌感染，应加用抗生素。
渗出性中耳炎初始治疗中不使用抗生素，但如果中耳渗液持续3个月以上则应考虑使用抗生素。急性中耳炎、化脓性中耳炎有使用抗生素的指征时，抗生素选择的原则是：首选青霉素或羟氨苄青霉素或复方磺胺甲基异嗯唑（SMZ），备选的有羟氨苄青霉素 棒酸或头孢克洛。疗程中必要时应根据细菌培养和药敏结果调整抗生素的使用。病原明确为支原体者选用大环内酯类，常用的有红霉素、罗红霉素或阿齐霉素。急性中耳炎无并发症者疗程7N10天，对鼓膜穿孔者和2岁以下年幼儿疗程常需适当延长。
单纯病毒性鼻窦炎无使用抗生素的指征。细菌性鼻窦炎首选对可能病原菌有效的、抗菌谱窄的抗生素，包括青霉素、羟氨苄青霉素。疗程：症状、体征改善后7天，一般为10N14天。复发性细菌性鼻窦炎的急性发作期或上述药物治疗3天临床无好转者，应选用对β-内酰胺酶稳定的青霉素类或头孢菌素类抗生素，疗程可以延长至3—4周。
病毒性扁桃体咽炎无使用抗生素指征。细菌性扁桃体咽炎及其化脓性并发症、非化脓性并发症（风湿病、肾小球肾炎等）者，均有使用抗生素指征，青霉素是首选抗生素；羟氨苄青霉素和第一代头孢类抗生素也可使用。青霉素过敏者可选用大环内酯类抗生素，包括红霉素、罗红霉素和阿奇霉素。疗程：无并发症的细菌性扁桃体咽炎抗生素疗程5—7天；风湿病、肾小球肾炎患儿的咽炎10N14天；一旦出现严重化脓性并发症者，抗生素疗程应视病情而延长。
无并发症的单纯病毒性喉炎无应用抗生素的指征。细菌性喉炎首选青霉素C、苯唑青霉素、羟氨苄青霉素。如明确为耐甲氧西林金黄色葡萄球菌（毫RSA），应选用万古霉素；如为耐药流感嗜血杆菌、大肠杆菌，可以选用羟氨苄青霉素 棒酸或二、三代头孢菌素类。抗生素疗程一般均为5—7天。
急性会厌炎细菌是主要病原，首选三代头孢菌素类如头孢噻肟或头孢曲松，疗程通常为5—7天。
所有抗生素治疗中应根据细菌培养与药敏结果调整抗生素的使用。抗生素具体怎么用呢？青霉素5万一10万单位/（千克·次），每6小时1次肌内注射或静脉滴注；SMZ（TMP/SMZ）剂量计算（4/20）毫克/（千克·次）[最大（160/800）毫克/次]，每12小时1次，口服；羟氨苄青霉素15—25毫克/（千克·次），每8—12小时1次静脉滴注，或8—12毫克/（千克·次），每6—8小时1次口服；羟氨苄青霉素 棒酸，25毫克/（千克·次）[最大1000毫克/次]，每8小时1次静脉滴注，或25—50毫克/（千克·天）[最大500毫克/次]，分成3—4次口服；头孢克洛10毫克/（千克·次）（最大500毫克/次），每8小时1次口服；苯唑青霉素50毫克/（千克·次），每6小时1次静脉滴注；万古霉素10—15毫克/（千克·次），每6—8小时1次静脉滴注；头孢噻肟50毫克/（千克·次）（最大2克/次），每8小时1次静脉滴注；头孢曲松50毫克/（千克·次）（最大2克/次）每天1次静脉滴注。红霉素15毫克/（千克·次）（最大500毫克/次），每8小时1次口服，或每12小时1次静脉滴注；罗红霉素4毫克/（千克·次）（最大150毫克/次）
每12小时1次口服；阿奇霉素10毫克/（千克·次）（最大500毫克/次），每天1次，口服3天。