海底地震是对航行在海上的人们的又一大威胁。1959年春，前苏联客货轮“库鲁”号在勘察加沿海海域航行，突然受到震动，好像有只大铁锤不停地敲打船底，每打一次，船身就剧烈地抖动一下，船上的舵轮、雷达全部失灵，罗盘也出了故障。海面上腾起无数水柱，周围出现一片白色的泡沫。
1964年3月21日，美国阿拉斯加地震发生时，前苏联“坚定”号救护船正在距安克雷奇市250海里的公海上。它在5分钟之内竟受到3次剧烈震动，就好像全速前进的船只，猛地撞上了大块礁石一般。
在海底地震中，船只损失的大小取决于地震强度，也取决于船只与震中的距离。科学家认为，由海底传递到海面的地下震动，在震源地区感觉最明显，5～6级的地震便可以毁坏船体，掀掉锅炉和发动机。
对停留在港内的船只来说，最危险的则是海底地震造成的海啸。地壳急骤升降，迫使几千米长的水柱发生运动，在海水上层形成巨大而迅猛的波浪，当波浪涌进浅水海域时，浪头骤然增高，速度放慢，像一面墙一样倾倒在岸上。狭长的海湾和楔形港口里，海啸的浪头尤其大。
1958年7月9日晚，美国阿拉斯加东南的里都亚港发生了一次地震。潮水所到之处，淹没山坡，冲毁树林。潮水过后，只留下一片光石秃岭。
海底火山爆发也常常给海上船只带来惨重的灾难。1952年9月23日，东京南225海里的一座礁石附近，火山爆发。首先来到这里的一艘日本海上防卫厅的考察船，发现海面上出现了一个新岛，海拔高度30米，直径150米。几天之后，小岛却消失了，但火山口还在继续喷射，火山熔岩流入海里，蒸汽变成云彩升上天空。这时，东京渔业研究所的一艘水文考察船又驶近火山爆发区，正当船上人员开始摄影、测定火山威力、选取当地水土样品时，第二次火山爆发，考察船当即被蒸汽和灰烬吞没了。火山喷射物散落以后，海面上再也不见船的踪影。直到过了很久，船的残骸才被找到。
人们往往并不知道，有时来自火山的危险并非是火山本身，而是火山的喷发物——火山灰、水蒸气等，它们像浓雾一样，降低能见度，使船只陷入死亡境地。