25年（东汉建武元年）
窦融据河西，行五郡大将军事，辛彤为敦煌太守。（《后汉书·窦融传》）
46年（建武二十二年）
十月，“诏罢诸边郡亭候卒”。敦煌郡所属四部都尉当罢于是年。（《后汉书·光武帝纪》）
冬车师前王、鄯善、焉耆等十八国俱遣子入侍，愿得都护，朝廷还其侍子。会莎车王贤自负矢强，欲并兼西域，攻击诸国，诸国侍子乃留敦煌，诸国乃与敦煌太守裴遵檄，愿留侍子于敦煌，裴遵以状闻，天子许之。（《后汉书·西域莎车传》）
51年（建武二十七年）
“闭玉门以谢西域之质，卑词币以礼匈奴之使”。（《后汉书·臧宫传赞》）
敦煌西北之玉门关当废于是年。
74年（永平十七年）
秋八月丙寅，令武威、酒泉、敦煌及张掖属国系囚右趾己下任兵者，皆一切勿治其罪，诣军营。
冬十一月，遣奉车都尉窦固、驸马都尉耿秉、骑都尉刘张出敦煌昆仑塞，击破白山虏于蒲类海上，遂入车师。初置西域都护，戊己校尉。五船道自此打通。约在本年于冥安县西北新建玉门关。（《后汉书·明帝纪》）
76年（建初元年）
正月，发张掖、酒泉、敦煌三郡及鄯善兵击车师，匈奴遁。三月，耿恭等从车师还敦煌。（《资治通鉴》卷四十五、《后汉书·章帝纪》）
91年（永元三年）
班超遂定西域，因以超为都护，居龟兹。（《后汉书·西域传》）
102年（永元十四年）
八月西域都护班超人玉门关还至洛阳。（《后汉书·班超传》）
107年（永初元年）
西域反叛，以勇（班勇）为军司马，与兄雄俱出敦煌，迎都护及西域甲卒而还。因罢都护，后西域绝无汉吏十余年。（《后汉书·班超传》）
108年（永初二年）
春伊吾卢，柳中屯田吏士，还至敦煌。（《后汉书·梁懂传》）
119年（元初六年）
置西域副校尉居敦煌，部营兵三百人，敦煌太守曹宗遣索班行长史，将千余人屯伊吾，于是车师前王及鄯善王来降。翌年被后部王军就（军就，名也）攻没索班及部众。（《后汉书·西域传》）
123年（延光二年）
敦煌太守张珰上书，陈西域三策（《通鉴》卷五十）以为敦煌宜置校尉，帝纳之。（《后汉书·西域传》）
夏，复以勇为西域长史，将兵五百人出屯柳中。（《后汉书·班超传》）
自建武至于延光，西域三通三绝。（《后汉书·西域传》）
125年（延光四年）
秋，班勇发敦煌、张掖、酒泉六千骑及鄯善、疏勒、车师前部兵，击后部王军就，大破之，首虏八千余人，马畜五万余头。捕得军就及匈奴持节使者，将至索班没处斩之，以报其耻，传首京师。（《后汉书·班超传》）
127年（永建二年）
班勇上请攻焉耆元孟，于是遣敦煌太守张朗将河西四郡兵三千人配勇。因发诸国兵四万余人，分骑为两道击之。元孟俱诛，逆遣使乞降，张朗径入焉耆受降而还。（《后汉书·班超传》）
129年（永建四年）
春，北匈奴呼衍王率兵侵后部，乃令敦煌太守发诸国兵及玉门关候、伊吾司马，合六千三百骑救之。（《后汉书·西域传》）
137年（永和二年）
北匈奴呼衍王侵车师后部，敦煌太守裴岑发郡兵三千北出救之，勒石纪事。（《裴岑碑》）
151年（元嘉元年）
北匈奴呼衍王将三千余骑寇伊吾，遣敦煌太守马达将敦煌、酒泉、张掖属国吏士四千余人救之，出塞至蒲类海，呼衍王闻而引去，汉军无功而还。（《后汉书·西域传》）
自是以后，北匈奴不见于中国史。
153年（永兴元年）
敦煌太守宋亮，立车师后部故王质子卑君为王。（《后汉书·西域传》）
170年（建宁三年）
凉州刺史孟佗遣从事任涉将敦煌兵五百人，与戊己司马曹宽、西域长史张晏、将焉耆、龟兹、车师前后部，合三万余人，讨疏勒，攻桢中城，四十余日不能下，引去。（《后汉书·西域传》）
185年（中平二年）
邰阳县掾王敞等，为邰阳令敦煌人曹全刊碑颂绩。（《曹全碑》）
192年（初平三年）
敦煌大书法家“草圣”张芝卒。（《后汉书·张奂传》）
216年（建安二十一年）
酒泉黄华攻破效谷城，此城遂即废坏。唐代犹存北垣颓基数十步。（P．2005《沙州都督府图经》卷第三）