储存蜂蜜时，先选择纯净而不含杂质的蜂蜜，再将蜂蜜放入干净的玻璃瓶或陶瓷罐内，然后按每500克蜂蜜加一小片生姜的标准加入生姜，在密封后放在阴凉处储存，这样可使蜂蜜久放而不变质、不变味；如果发现蜂蜜发黏、发酵，就应把蜂蜜盛在玻璃容器内，放在锅中隔盆加热到63～65℃，并保温30分钟，就可以阻止发酵了。
再者蜂蜜种类不一，各有特色，要分品种储藏，防止混杂，以保持其原有的特色；同时蜂蜜呈弱酸性，能与金属起氧化反应，因此应采取非金属容器，如缸、木桶、无毒塑料桶等进行储藏；此外，蜂蜜内常有酵母菌存在，容易导致酸败，如果将蜂蜜盛入大口容器内，敞开放在干燥、通风、25℃以上的室内静置数天，待其蒸发掉多余的水分，完全成熟后再储存，就不会酸败了。