航母舰载机不使用时一般存放在机库里，机库位于飞行甲板的下面，是停放和检修舰载机的场所。数十架舰载机需要较大的地方停放，所以现代航母的机库有越来越大的趋势。舰载机在机库中处于折叠状态，排列紧凑有序，而且会空出必要通道，以便每架飞机迅速通过升降机升到飞行甲板上去。
在气候较好时，舰载机也可以停放在飞行甲板上，用索具系好均匀布置在飞行甲板和机库甲板的眼块上。这样，舰载机就不会在有风浪时滑动碰撞了。
开放式机库以机库甲板为强力甲板，这是直到“二战”中期航母仍采用的机库主要构造形式。其舰体的上甲板就是机库甲板，而机库和飞行甲板作为舰体的上层建筑来设计。这种构造的飞行甲板只承受飞机载荷，不需要纵向隔壁，机库占用舰的全宽，舰的两侧就是机库的两侧，机库面积大，但防护能力差。