造成学习困难的原因有很多，因人而异。一个学习困难的学生身上通常会有几种原因错综复杂地交织在一起。教师应对学习困难产生的原因作全面的分析，这样就可以帮助其有针对性地为学生提供解决困难的方法。
1.社会环境造成的不良影响
主要表现在两个方面：一是物理环境。工业化不断进步和发展所带来的环境问题越来越严重。比如工厂的废水排泄物对居民的饮用水源造成了一定的威胁，使得很多人出现饮水中毒的现象，这严重影响了儿童的脑力开发，特别是一些铅性毒物和空气污染严重影响孩子的智力。另外，学校周边环境对学生也会产生严重的影响。
二是人文环境。近年来传统的价值观念有所改变，社会功利思想和享乐之风越来越严重，学校已经不再是一片净土，社会不良群体的骚扰和低级庸俗意识的侵蚀，对儿童学习困难的形成起到了直接作用。另外，还有一些不法分子向未成年人兜售黄色、暴力等，严重影响未成年人成长的书刊或音像制品；在电影上频频出现的武打、侦探、恋情等镜头也无时无刻不在影响着少年儿童的心智成长；一些网吧、歌舞厅或游戏厅不再是未成年人的禁地，只要你手头有钱，就是几岁的孩子都能随便出入。这种现象极大地影响了学生的学习，导致学习困难的学生数量增多，并且难以改正。
2.学校教育方式的不当
儿童进入学校后，主要受到学校环境的影响。我国教育体制在教学观念、教学内容、教学方式、学习方式和教学评价均存在着一定的弊端，这也是学习困难的学生数量逐渐上升的原因。在教学观念上，教育思想比较落后，很多学校为了追求升学率，相当一部分教师就只重视学习成绩好的学生，而放弃了那些学习困难的学生。他们对成绩好的学生通常抱有非常高的学习期望，反之，对学习困难的学生则基本不抱任何希望。这种消极的心态必然会给孩子幼小的心灵带去沉重的打击，孩子感觉不到重视，自然情绪更加低落，也就更加无心学习。这样就形成了一个恶性循环，以后再想改正就会十分困难。在教学方式上，教师的教学方式比较陈旧和单一，利用频繁的题海战术中会让学生更加厌恶学习，从而对学习失去任何兴趣，也给自己学习成绩的提高增加了一定的障碍。而且，教师也不能够针对不同的学生作出适合其学习的教学方法，对待所有的学生都是那一套陈词滥调，学生自然不会取得进步。随着年级的增高，学习也就变得越来越困难。在教学管理上，很多学校将班级分为重点班和普通班，按照学生的学习成绩进行区别对待，这种方式只是导致原本学习成绩就不好的学生更加厌恶学习，加大了学生的失落感，最终导致他丧失积极进取的动力，甚至产生了习得性无能。在教学评价上，教师不注重过程只看重结果，更加大了学生的心理落差，同时也使得学生盲目崇拜分数，养成一种一切都为了分数的思维模式，导致那些学习困难的学生总是产生失败者的自我认识，自我概念降低，变得消极自卑。另外，师生之间的关系不够和谐也在一定程度上极大地影响了学习困难学生的积极进取性。调查表明，大部分学习困难学生在班级中缺少温暖，由于学习成绩不好，很少跟老师和同学进行互动、交流，导致其人际关系较差，并被冷落和孤立。这些都会挫伤学生的自尊心和求知欲，造成学习困难的情况更加严重。
3.家庭教育的不良原因
家庭是孩子的第一所学校，父母是孩子的第一任老师。如果家长过于放纵和溺爱孩子，就会使孩子养成凡事以自我为中心的坏毛病：如果家长不懂教育知识，只是随自己的性情进行教育，或者是对子女的期望过高、要求过分，都会对孩子的成长造成一定程度的消极影响，这些也是造成孩子学习困难的原因之一。其主要表现为：
一是家庭结构缺陷。单亲家庭的孩子往往会因为缺少家庭的温暖和爱心，造成形单影只，形式不爱轻易接近别人的性格习惯。
二是教育方式不当。有的父母望子成龙的心思很浓重，一旦孩子无法达到他们的期望，就对孩子进行拳打脚踢，由此给孩子带来了严重的精神负担，使得孩子总是害怕学习和考试，对学习产生恐惧和焦虑，严重的时候孩子会产生抵触学习的情绪，使得学习成绩越来越差。有些父母对孩子极度宠爱，在生活上想方设法会满足孩子的所有要求，在学习上也是孩子说什么就是什么，从来不会多管一句，甚至在孩子出现问题、犯了错误的时候，也会包庇袒护，这样对孩子的成长极为不利。
三是家庭学习环境较差。有的家长因为感情破裂，经常发生吵架或者打闹现象，家里动不动就要上演一出苦情戏，这给孩子带来情感及学习上的不良影响，同时也造成心理上的压力和恐惧，这些都会直接影响孩子的学习；有些家长经常喜欢找很多邻居聚集在一起打麻将，即使深更半夜也还是乐此不疲。嘈杂的环境让孩子无法安静地学习，孩子白天在学校学到的功课也就无法按时掌握，长时间下去一定会造成知识链的松脱，以后再想找机会补救可就来不及了。
4.学生自身的原因
学生的智力水平、认知能力和学习动机在一定程度上都会影响到其学习成绩。研究表明，学习困难学生的神经心理功能发展具有一定的不平衡性，感觉统合失调、注意发展障碍、学习策略不良以及学习动机水平偏低；在注意力、组织能力、反应能力及社会适应能力上也比正常的孩子差；在学习方式上，没有正确的学习策略和方法，元记忆监测与控制能力不合格；意志薄弱，缺乏坚持性，遇到挫折就想逃跑。也有个别学习困难学生是因为身体素质较差，经常缺课造成功课连续性间断，学习内容出现断层，最终造成了学习困难。另外有些学生在身体方面虽然没什么缺陷，但心理发育不够成熟也严重影响了他们的学习。