前面讲了各类湖泊的形成，那么这些湖泊又是如何分类的呢？
地球表面上的湖泊众多，它们的成因各不相同，湖水的排泄情况和水质等也不尽相同。若是要将湖泊进行分类，分类标准也多种多样。如果依据湖泊的成因来分，就像前面所说的，可以分为构造湖、火口湖、河成湖、堰塞湖、冰川湖、岩溶湖、海成湖、风成湖、人工湖等；若是依据湖水的排泄情况分类，湖泊可以分为外流湖和内陆湖。外流湖指的是湖水河流或其他水道与海洋相连，一般是淡水湖；内陆湖指的是地处大陆内部，不与海洋相通，只接纳河水和冰雪融水、泉水等的湖泊，此类湖以咸水湖居多；依据水质划分，也就是按照湖水的矿化度来分类，可以分为淡水湖、咸水湖和盐湖。矿化度小于1克/升的称为淡水湖；矿化度为1～35克/升的称为咸水湖；矿化度大于35克/升的则为盐湖。
此外，依据湖泊的热状况分类，可分为热带湖、温带湖和寒带湖。湖水平均温度全年均在4℃以上，除秋冬全同温以外均为正分层的为热带湖；湖水平均温度有时在4℃以上，有时在4℃以下，夏季正分层，冬季逆分层，春秋两季为全同温的为温带湖；平均温度全年均在4℃以下，除春夏全同温外均为逆分层的为寒带湖。还可以依据湖水中所含营养物质的多寡，可以分为富营养湖、中营养湖和贫营养湖。除了上面所介绍的以外，还可以按其他标准划分各类湖泊。
湖泊按照干涸源变化，分为消涨湖、游移湖；按含盐多少，可分类为咸水湖、淡水湖、盐湖；按水流情况可分类为外海湖、内陆湖。