几天后，鸣人在三代的带领下来到了木叶学院，由于今天是报名日所以有很多大人带着小孩前来报名，在这里鸣人见到了木叶日后的九小强，这也正是他来这里的目的。很快，报名结束了，鸣人走到教室中找了个位置坐下，他打量了一下众小强们发现只有永远睡不醒的奈良鹿丸、头上趴条狗的犬冢牙、成天带着墨镜的油汝志乃、爱吃的秋道丁次、小樱死党山中井野、暴力女春野樱、成天装酷的宇智波佐助、看到鸣人就脸红的日向雏田来了，只剩最后的日向宁次和洛克李还没到，不久之时空通道中的叶天翔此时可不好受，若不是因为他现在只是灵魂的话只怕他早已吐了。不知过了多久，眩晕感消失了，叶天翔的大脑也不知道用了多长时间才重新恢复清明。“呵，没想到居然会和银河火花融合，这样一来我的生命力岂不是就成无限的了，毕竟光是永恒不灭的。“叶天翔如是想到，突然他的脑海中多出了一种信息。“嗯?《大宇宙无极决》?无极决共分十二层对应奥特曼的十二境界分别为:勇士、中级勇士、战士、精英战士、传说战士、神话战士、星空战神、小宇宙、大宇宙、无极、无极小宇宙和无极大宇宙!因为与我融合的是银河奥特曼所以我的境界直接就达到了精英战士巅峰，最厉害的是这套功法修炼出的光力量可以转化为任何其他力量!”叶天翔看完这功法的简介后激动的无法自语，虽然通过观察后发现自己还是个还没出生的婴儿，但婴儿的好处就是先天经脉畅通无阻正是修炼的最佳时机。于是，他开始了平生第一次修炼，首先他从第一层开始运行，他打算把体内的光全部转化为无极之光，也许是因为他经脉畅通也许是因为别的，他没费多大劲就转化完成了，就在此时一阵吸力从下方传来，他知道自己将要出生了。
不知过了多久，叶天翔睁开了他的小眼睛，不过他很快就被眼前的一切惊呆了。只见此时一个满头金发身穿白色长袍的男子和一个粉红色头发身上同样是粉红色的女子正满脸笑容的看着自己。“这……这不是火影忍者中的四代火影波风水门和他妻子漩涡幸玖奈吗?难道这里是火影世界，而我成了鸣人，如果真是这样那也太……“叶天翔想到这里算是明白了，怪不得那老人说我重生后不会有人生地不熟的情况，还说被我取代之人我很熟悉，不过，要给这个世界带来和平的任务也确实太难了吧，不过对于有系统的他来说却是个未知数。就在这时，一个带着面具的人突然出现在账蓬内。“报告，九尾已经逼进这里了。““嗯，我知道了。”水门说完回过头来看着鸣人，他说道:“玖奈，我们走吧。”之后水门就抱着鸣人走出了账蓬，很快他们就来到了一个类似祭台的地方，之后发生的一切如同原著一般，九尾被封印在鸣人体内，波风水门夫妇战死，但不同的是在九尾入体的那一瞬间，鸣人的脑海内就响起了系统的提示:能量补充完毕，光明系统正式启动，由于是初次启动且宿主修为达到精英战士巅峰，所以特地奖励光明点十万!且今后会自行吸收外界能量进行充能。对于这样的结果鸣人自然是很满意。
时光如流，七年时间一闪而过，今年的鸣人已经七岁，按照剧情来看今年就该去忍者学校上课了，虽然以鸣人现在的实力已经没必要再去那里。在这七年内鸣人的实力可谓是突飞猛进，不仅如此他还利用光明点兑换了多种忍术来修炼，现在他会的忍术比三代火影还多，但在威力方面却不好说了，虽然他变成奥特曼后的实力很恐怖，但他总不能每次打架都变身吧，所以对于自己本身的实力他同样很看重。值得一提的是，他在两年前救下雏田时成功觉醒了轮回眼，不过根据系统提示，现在的他还不足以自由操控轮回眼，所以就封印了一部分，让他慢慢适应，至于他要怎样隐藏轮回眼，你觉得以那个系统兄的能力会办不到吗?，宁次和小李终于来了随之而来的还有从小就对鸣人很照顾的海野伊鲁卡，之后这几天的课堂上鸣人都有认真听讲，虽然伊鲁卡所说的三身术他早已学会。日子一天天过去了，鸣人也成功与小强们交上了朋友，就连一向沉默寡言的佐助和志乃也开始变得有笑容。
这一天，鸣人正在家中修炼光之力量，突然鸣人觉得眼前一黑，当他睁开眼时发现自己正处于一个类似下水道的地方。“嗯?这里是……九尾的封印!”鸣人有些惊讶但同时也有些惊喜，这九尾虽然是这世界所有负面能量的结合体但是心地还没坏到无可救药的地步，鸣人径直走了一会就发现了被封印的九尾。“哟，你好啊，九喇嘛”“嗯?你这小鬼怎么知道我的名字?”九尾有些惊讶的问道，“嘛，就是觉醒这双眼睛时多出的记忆告诉我的。“鸣人说完就展现出了他的轮回眼，九尾看到鸣人的轮回眼时有些惊讶，他没想到自己现在的人柱力会继承六道仙人的力量，当初六道对自己十分照顾，偶尔帮一下这个小鬼也算不负六道的恩情了。“嗯，说实在的，我挺想杀了你的，不过看在六道的份上我不但不会伤你还会帮你。”九尾开始妥协了，鸣人也没有想到九尾居然如此尊重六道仙人。“多谢了，你放心，日后我会放你出去的，还可以帮你解除与那个人的通灵契约。”鸣人说完便离开了，第二天鸣人就开始了以奥特曼的形态修炼忍术，经过尝试鸣人惊喜的发现以光之力量施展的忍术破坏力不是一般的变态！接下来的几天鸣人经常找佐助和小樱等人一同修炼，他还不知道此时的银河系正发生一场巨大的灾难（详情请看《重生之超银河》外传）。
就这样又是五年过去了，此时鸣人的实力已经不比精英上忍差多少，银河奥特曼的力量也成功达到了传说级中期，除此之外他还兑换了不少奥特曼的绝招来修炼，至于九尾嘛，早已被治的服服贴贴了。他的同伴们也变强了不少，也只有佐助还沉浸于灭族的悲伤中，后来经过鸣人的开导再加上同伴的安慰缓解了不少，后来鸣人实在是忍不住了就把真相告诉了佐助，得知真相的佐助虽然不知道鸣人是如何得知的，但他却不认为鸣人会骗他，他知道这一切都是团臧造成的与村子无关，他与鸣人约定日后定要杀死团臧，反正鸣人也不喜欢这个一心只想当火影的人。只是他们还不知道团臧前几日得到了一柄黑色的短剑和十几个人偶般的东西，这些正是掉入这个世界的黑暗火花和黑暗火花人偶！只是掉入这个世界的火花人偶明明有五十多个，为何团臧只有十几个就不得而知了。